Centre de traitement de données pour les essais en cancérologieCentre d'investigation clinique et d'épidémiologie clinique 7 (CIC-EC7)Equipe de biostatistique Inserm U 897Unité de Soutien Méthodologique à la Recherche Clinique et Epidémiologique du CHU de Bordeaux (USMR)Centre de traitement de données de MontpellierPlateau technique de traitement de l'information pour l'épidémiologie, la recherche clinique et la santé publique (Tiers-Mip)Centre de traitement de données (CTD) pour les essais en cancérologie de Bordeaux - Label INCa
Resp. : Simone Mathoulin-Pélissier 
05 56 33 33 98
Resp. adjoint : Adélaïde Doussau 05 56 57 56 63
Contact - Site
Localisation: Simone Mathoulin-Pélissier - Institut Bergonié - 229, cours de l'Argonne - 33076 Bordeaux cedex
Description : Développement d'essais cliniques académiques pour tous les types de cancer, spécificité pour les sarcomes. Expertise méthodologique de haut niveau (choix de schémas optimaux, essais complexes, analyses à long terme). Qualité des données (e-CRF, randomisation, data-management).
Equipement : Travail de collaboration et accès aux équipements et logiciels des unités : Unité de Recherche et Epidémiologie Clinique (UREC) de l'Institut Bergonié, Unité de Soutien Méthodologique à la Recherche clinique (USMR) du CHU de Bordeaux, Inserm U897 (Epidémiologie et Biostatistique, CIC-EC 7) et Institut de Santé Publique, Epidémiologie et Développement de l'Université Bordeaux 2 (ISPED).
Développements : programmes d'innovation méthodologique dans le CTD et dans 2 réseaux européens : Tenalea et Ecrin.
Projets : 17 essais cliniques et études liées à des essais cliniques en 2009. Exemples : Études Optimon, évaluation de l'efficacité et du coût de 2 stratégies de monitorage pour la recherche clinique institutionnelle (G. Chêne). Etude Oncodage, validation d'un outil de dépistage gériatrique en oncologie (P. Soubeyran, M. Rainfray).
Perspectives : Développement de l'axe méthodologique et ouverture à d'autres promoteurs du CGSO et du territoire national.
Personnel : 2 et personnel des unités constituantes.
Qualité : Mise en place des procédures opératoires standardisées propres à la structure et démarche commune avec le référentiel qualité des CIC (HP-CIC 2010).
Resp. : Geneviève Chêne - 05.57.57.11.29.
Localisation: ISPED / CIC-EC - 146 Rue Léo Saignat - 33076 Bordeaux Cedex
Objectif : Soutien méthodologique et logistique à la réalisation de projets d'épidémiologie clinique.
Description : Le CIC EC dispose de compétences en méthodes épidémiologiques et biostatistiques, soutien à la réalisation d'études et assurance qualité, gestion informatisée de données. Il peut également participer à la recherche de financement ou la valorisation d'études. Il contribue à faciliter la relation des chercheurs avec les structures de soins et les réseaux de médecins généralistes ou spécialistes de la Région. Il assure également une activité de formation. Le CIC EC dispose du soutien de l'USMR du CHU de Bordeaux, du CIC, de l'U897 (épidémiologie et biostatistique) et de l'U657 (pharmaco-épidémiologie), du CTD de Bordeaux-Aquitaine.
Projets : Depuis sa création, le CIC EC a pris en charge 11 projets. Il a notamment collaboré avec le registre des cancers de la Gironde, le registre des tumeurs primitives du SNC de la Gironde (projet CERENAT cf. reg. TPSNC), l'Observatoire des cancers hépatocellulaires en Aquitaine.
Développement : Le CIC EC poursuivra ses activités sur les grands projets existants de suivi de cohorte de patients et en population et collaborera au développement de nouveaux projets ambitieux avec les services cliniques hospitaliers. Trois thématiques seront renforcées : les projets en cancérologie, les maladies chroniques avec notamment la maladie d'Alzheimer, la recherche en médecine générale.
Accès : Prendre contact par mail. Les études de cohortes ou les grandes enquêtes en population générale associant l'INSERM et le CHU, dans un cadre régional ou interrégional, sont prioritairement éligibles pour être rattachées à cette structure.
Personnel : 3,5
Resp. : Daniel Commenges - 05 57 57 11 82
Resp. Opérationnel : Virginie Rondeau - 05 57 57 45 31
Localisation : ISPED - Univ. Victor Segalen Bordeaux 2 - Case 11 - 146 rue Leo Saignat - 33076 Bordeaux cedex
Site
Objectifs : L'équipe développe des modèles dynamiques en épidémiologie. Ces méthodes sont appliquées à l'étude du vieillissement cognitif, au SIDA et au cancer.
Compétences : Activités 4 axes : méthode d'analyse d'évènements (analyse de survie appliquée au cancer), analyses de données longitudinales, modélisation de l'interaction hôte-pathogène, développement de logiciels sous R.
Projets : Dans le champ du cancer, l'équipe de biostatistique suit 5 axes de recherche (en collaboration avec le CTD voir 2) : méthode pour l'analyse de données récurrentes (applications aux données de récidive de cancer), modèle à fragilité partagée et modélisation conjointe/ modélisation d'évènements répétés et du décès (application aux récidives de lymphomes folliculaires), modèles de mélange et cancer (« cure frailty model »). Création d'un logiciel sous R pour valoriser et diffuser l'ensemble de ces méthodes (library frailtypack). Application à la prostate de travaux sur l'étude de données longitudinales.
Personnel : 15
Resp. : Geneviève Chêne - 05.
Localisation:
Objectif :
Description :
Projets :
Développement :
Accès :
Personnel :
Centre de traitement de données de Montpellier - Parc Euromédecine - 34298 Montpellier cedex 5 - Label INCa
Resp. : Jean-Pierre Bleuse
Resp. Opérationnelle : Sophie Gourgou-Bourgade
Objectif : Mission de gestion, d'analyse des essais thérapeutiques, suivi et développement de nouvelles méthodologies afin de proposer de nouveaux outils biostatistiques et informatiques permettant une optimisation de l'interprétation des résultats d'études cliniques ou biologiques.
Description : Les principaux projets de recherches portent sur les marqueurs tumoraux et biopuces, les essais d'association de plusieurs drogues, les études des effets à long terme, les interactions toxicité-efficacité, les règles d'arrêt précoce des événements indésirables graves, la qualité des essais cliniques en oncologie, l'optimisation de la fréquence des visites post-thérapeutiques , les essais randomisés en clusters.
Equipement : logiciels spécialisés planification des essais (EaST) ; randomisation (TenAlea) ; gestion des données biomédicales (Clinsight/Capture System) ; analyse statistique (Stata et SAS).
Projets : en dehors de la gestion des essais thérapeutiques et des bases de données, développement de 2 axes : développement de nouveaux outils méthodologiques en biostatistique appliquée au cancer (arrêts précoces dans les essais basés sur une surveillance séquentielle des effets indésirables graves, optimisation des rythmes de surveillance post-thérapeutiques, évaluation des définitions des critères de survie utilisées dans des revues médicales, évaluation des méthodes statistiques des essais de phase II publiés dans des revues de cancérologie), biostatistique appliquée à la recherche fondamentale biologique (évaluation de l'efficacité et de la tolérance des modulateurs de réponses biologiques, essais d'intervention et prévention, évaluation de signature génétique prédictive de la réponse aux traitements).
Production : développement de logiciels de stratégie d'escalade de doses dans les essais de phase I (np1), d'évaluation multi variée des marqueurs tumoraux (mROC), d'évaluation des effets récurrents et transitoire à long terme (preval).
Qualité : Nombreuses procédures rédigées et mises en place pour assurer une homogénéité dans l'exécution de différentes tâches, en respectant la législation.
Personnel : 11
Plateau technique de traitement de l'information pour l'épidémiologie, la recherche clinique et la santé publique (Tiers-Mip) - FR Santé société
Resp. : Thierry Lang - 05 61 14 59 20
Localisation : Faculté de médecine de Purpan - 37 allées Jules Guesde - 31073 Toulouse
Site - rubrique Ressources communes.
Description : Dédié au traitement et à l'analyse des données en santé humaine, le PT réunit des moyens de gestion des données et de calcul statistiques. Participation à l'élaboration des projets (aide méthodologique au montage de projets, y compris les aspects réglementaires). Analyse statistique des données. Aide à la valorisation et aux publications. Réalisation de masques de saisie et contrôle des données. Saisie des données. Accès sécurisé au serveur de calculs Gestion et stockage de données.
Equipement : Serveur de calcul (Windows serveur 2003, biprocesseur 2.7G avec 8G de ram et 5 disques dur en RAID5, 10000 tour/min, 146G chacun), serveur de sauvegarde, miroir des serveurs sur une machine. Logiciels : STATA9, SAS9.1, R2.21, PEST4, STAT transfert 9, HLM6.06 et PRIage PRO 2008. Plateforme accessible en VPN. Accès crypté.
Projets : Transfert de tissu graisseux pour le traitement des séquelles modérées du traitement conservateur du sein. Etude multicentrique (PHRC nat) ; Surimpression radiothérapique des glioblastomes guidée par l'imagerie spectrométrique de résonance magnétique (PHRC nat) ; Analyse du vécu de la douleur chez les cancéreux (Inserm) ; Autofluorescence dans le dépistage des lésions cancéreuses en consultation d'otorhinolaryngologie (PHRC) ; Traitement d'entretien du myélome après autogreffe de cellules souches chez les sujets âgés de moins de 65 ans. Protocole IFM 2005 02 (PHRC).
Qualité : Processus de contrôles de qualité et traçabilité des actions selon les référentiels mis en place et validés par le Réseau Français des Unités d'Essais cliniques.
