Canceropole-GSO

Le 1^er workshop du groupe de travail "Biologie Spatiale" du Cancéropôle GSO se tiendra le jeudi 7 septembre à Toulouse.

Objectif : la journée vise à rassembler les utilisateurs (actuels et futurs) du Grand Sud-Ouest ayant besoin d'informations sur les approches de biologie spatiale basées sur la transcriptomique et l'imagerie.

Les présentations auront pour objectif de discuter la faisabilité des technologies déjà implémentées dans le GSO ou bientôt disponibles. 

-> Des interventions "plénières" proposeront des retours d'expérience de laboratoires de recherche publique du GSO (ou au-delà),
-> Des moments d'échanges et table-rondes permettront d'aborder les difficultés, limites et solutions dans l'implémentation de ces approches.

Inscription en ligne

Programme prévisionnel

09h15 : Accueil

09h40 : Introduction - Frédéric Lopez (CRCT, Toulouse) et Julien Faget (IRCM, Montpellier)

Matinée : retours d'expérience de technologies implémentées dans les laboratoires de recherche publique du GSO (ou au-delà)

• Approches basées sur la transcriptomique par séquençage
  • Biologie spatiale à différentes résolutions et modalités (expression génique, mutations, élasticité des tissus) - Jacques Colinge, IRCM, Montpellier et Evelyne Crapez, ICM, Montpellier
  • Etude de l'invasion tumorale et des invadopodes par des techniques de biologie spatiale (Retour d'expérience GeoMx DSP NanoString©) - Marc Mesnil & Norah Defamie, Université de Poitiers

• Approches basées sur la transcriptomique par imagerie
  • Retour d'expérience CosMx NanoString©
  • Retour d'expérience de la plateforme MerscopeTM de Vizgen - Pascal Barbry, IPMC, Nice

• Approches basées sur l'imagerie protéomique
  • Retour d'expérience avec l'Hyperion Imaging System (Fluidigm ©) - Henri-Alexandre Michaud, Plateforme CIM, IRCM, Montpellier et Matthieu Lacroix, IRCM, Montpellier
  • Retour d'exprience MACSima© Miltenyi - Intervenant à confirmer du Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille

• Approches alternatives
  • Profilage protéomique tumoral LC-MS/MS pour répondre à des besoins cliniques non résolus - Anne-Aurélie Raymond, BRIC & Oncoprot, Bordeaux et Arthur Marichez, BRIC & CHU de Bordeaux
  • Décrypter le microenvironnement et le métabolisme des tumeurs grâce à des stratégies d'imagerie multimodales (IF et MALDI) - Landry Blanc, CBMN, Bordeaux
  • Adaptations métaboliques dans le glioblastome et communication avec le microenvironnement (intégration de différents jeux de données) - Thomas Daubon et Johanna Galvis, UMR5095 CNRS - IBGC, Bordeaux

Buffet

Après-midi

Table-rondes

• Approches spatiales basées sur la transcriptomique
• Approches spatiales basées sur l'imagerie

Plénière "Traitement et analyses des données de biologie spatiale"

• Vera Pancaldi, CRCT Toulouse

17h00 : Restitution et conclusion

Lieu : Amphithéâtre de l'IUCT Oncopôle, Toulouse. Accès >>

Contact : Pour toute demande d'information, n'hésitez pas à contacter les chargés de mission du Cancéropôle Grand Sud-Ouest