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CNRS Formation entreprises - ChIP-seq, RNA-seq et Hi-C : traitement, analyse et visualisation de données - 16-20 mai

Formations Autres

A lieu le 16 mai 2022 à partir de 14h00
jusqu'au 20 mai 2022 à 17h00

  • Lieu : IGMM (Montpellier)

Description

Cette formation portera sur les bases du traitement, de l'analyse et la visualisation de données de type ChIP-seq, RNA-seq et HI-C. Bien que visant un public d'entreprise, ce stage est aussi parfaitement adapté à des académiques (ingénieurs et chercheurs biologistes).

Les principaux objectifs de cet atelier sont les suivants :

- Savoir planifier une expérience simple de type ChIP-seq ou RNA-seq
- Savoir évaluer la qualité des données obtenues dans le cadre de la régulation des gènes (ChIP-seq) et de l'analyse du transcriptome (RNA-seq)
- Maîtriser les principales méthodes et outils d'analyse des données ChIP-seq et RNA-seq
- Savoir les visualiser dans un navigateur de génome et en extraire les coordonnées des pics enrichis
- Savoir manipuler et annoter les fichiers d'enrichissement (bedtools)
- Maîtriser les principales méthodes d'analyse des données Hi-C et de génération des cartes de contact chromosomique

Il s’agit d’une formation payante dont le nombre de places est limité à 12.

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