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Atelier formation CNRS entreprise - Traitement données ChIP-seq, RNA-seq, Hi-C - 9 -12 juin 2020

Formations Autres

A lieu le 09 juin 2020
jusqu'au 12 juin 2020

Description

Cet atelier de 4 jours portera sur les bases du traitement et de l'analyse de données de type ChIP-seq, RNA-seq et HI-C. Bien que visant un public d'entreprise, ce stage est aussi parfaitement adapté à des académiques (étudiants, ITA, postdoc, chercheurs).

Les principaux objectifs de cet atelier sont les suivants :

- Savoir planifier une expérience simple de type ChIP-seq ou RNA-seq
- Savoir évaluer la qualité des données obtenues dans le cadre de la régulation des gènes (ChIP-seq) et de l'analyse du transcriptome (RNA-seq)
- Maîtriser les principales méthodes et outils d'analyse des données ChIP-seq et RNA-seq
- Savoir les visualiser dans un navigateur de génome et en extraire les coordonnées des pics enrichis
- Savoir manipuler et annoter les fichiers d'enrichissement (bedtools, DAVID)
- Maîtriser les principales méthodes d'analyse des données Hi-C et de génération des cartes de contact chromosomique

Il s’agit d’une formation payante dont le nombre de places est limité à 12 et qui se déroulera sur le campus du CNRS de Montpellier.

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