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Atelier Analyse de Données Génomiques, 20-23 mai 2018

Formations Autres

A lieu le 20 mai 2019
jusqu'au 23 mai 2019

  • Lieu : Campus du CNRS de Montpellier
  • Organisateur : Amal Makrini, Léo Pioger et JC Andrau

Description

Atelier de 4 jours sur les bases du traitement et de l'analyse de données de type ChIP-seq, RNA-seq et HI-C. Bien que visant un public d'entreprise, ce stage est aussi parfaitement adapté à des académiques (étudiants, ITA, postdoc, chercheurs).

Les principaux objectifs de cet atelier sont les suivants:

- Savoir planifier une expérience simple de type ChIP-seq ou RNA-seq
- Savoir évaluer la qualité des données obtenues dans le cadre de la régulation des gènes (ChIP-seq) et de l'analyse du transcriptome (RNA-seq)
- Maîtriser les principales méthodes et outils d'analyse des données ChIP-seq et RNA-seq
- Savoir les visualiser dans un navigateur de génome et en extraire les coordonnées des pics enrichis
- Savoir manipuler et annoter les fichiers d'enrichissement (bedtools, DAVID)
- Maîtriser les principales méthodes d'analyse des données Hi-C et de génération des cartes de contact chromosomique

Il s’agit d’une formation payante dont le nombre de places est limité à 12 .

Détail du programme>>

Inscription sur le site cnrsformation>>

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