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Objectifs : promouvoir la mise en place d'une masse critique aussi bien en ressources qu'en compétences afin de conduire des projets de recherche interdisciplinaires nécessitant la coopération d'équipes provenant de domaines différents, comme la biologie cellulaire, la génomique et l'(épi)génomique, la mécanobiologie, la physique, la biologie des systèmes, la chimie et la clinique dans une vision intégrée utilisant la modélisation mathématique et les méthodes in silico. Ce Programme HTE s'étend de la recherche fondamentale à la recherche translationnelle (sans inclure néanmoins la recherche clinique) et est organisé en 4 Work packages.
Projets multidisciplinaires : Le présent AAP porte sur le WP1, dont l'objectif est de répondre aux questions suivantes par la sélection de projets scientifiques qui seront financés dans le cadre du Plan Cancer
-> L'exploration des interactions bidirectionnelles des cellules tumorales et de leur microenvironnement tumoral susceptibles de freiner ou favoriser la progression tumorale ;
-> La modélisation des voies de signalisation impliquées dans les échanges bidirectionnels entre les cellules tumorales et le microenvironnement ;
-> La reprogrammation du microenvironnement tumoral, notamment les cellules mésenchymateuses, endothéliales et les cellules immunitaires;
-> La modélisation de l'hétérogénéité de la tumeur à partir de données in vivo ou de modèles 3D, dans la contrainte du microenvironnement de la tumeur primaire et/ou des métastases ;
-> L'influence de microbiote sur l'architecture du stroma tumoral ;
-> Le développement de méthodes prédisant l'efficacité, la résistance au traitement ou la récidive de la tumeur selon le degré d'interaction de la tumeur dans son microenvironnement ;
-> Les mécanismes intégrés aboutissant à la transition épithélio-mésenchymateuse (EMT like) et la transition inverse mésenchymo-épithéliale (MET like) ;
-> Les nouvelles méthodes ou algorithmes permettant l'évaluation des traitements (combinaisons, de nouvelles stratégies, schéma d'administration) en ciblant les événements somatiques sous-clonales de la tumeur ou son microenvironnement.
Sont considérés hors champs :
-> Les approches génétiques ou épigénétiques s'appuyant seulement sur l'obtention de cartes de référence de haute qualité du génome ou de l'épigénome des cellules tumorales ;
-> Les essais cliniques.
Programme organisé par l'ITMO Cancer, en collaboration avec l’ITMO BCDE (Biologie cellulaire, développement et évolution) et de l’ITMO Technologies pour la santé. Cet AAP remplace les appels "épigénétique et cancer", "biologie des systèmes" et le volet modélisation de l'appel "physique mathématique".
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Date limite de soumission de la lettre d'intention : 15 avril 2016
